El objetivo primordial de los virus son los ficheros que se encuentran en un medio de almacenamiento como los discos duros o disquetes. Más concretamente serán infectados todos aquellos archivos, ficheros o documentos (los tres términos indican el mismo concepto, en general) que tengan la característica de ser programas. Un programa no es más que un fichero cuya extensión es EXE o COM, que se puede ejecutar para que realice determinadas operaciones.
También existen virus que se encargan de infectar ficheros que no son programas. No obstante, estos ficheros contendrán elementos, denominados macros, incluidos en ellos. Estas macros son programas que el usuario puede incluir dentro de un determinado tipo de archivos.
Otro de los objetivos fijados por los virus para sus ataques suelen ser los propios medios de almacenamiento. De esta forma, atacando a los lugares en los que se guardan ficheros, el daño provocado afectará a toda la información contenida en ellos.
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